Koufonissi ingår i ögruppen Kykladerna och ligger mittemellan Naxos och Amorgos. Koufonissi tillhör i sin tur - tillsammans med Iraklia, Schinoussa och Donoussa - en inofficiell ögrupp som kallas Småkykladerna. Till ytan är Koufonissi bara 6 km2, den minst bebodda ön i Kykladerna. Som en liten jämförelse är Koufonissi ungefär lika stort som Djurgården i Stockholm. Öns högsta berg är 113 m högt, ett dvärgberg om man jämför med berg på andra öar. Här bor drygt 360 personer, den huvudsakliga sysselsättningen är turism och fiske. I alla tider har fisket varit den huvudsakliga inkomstkällan och är så till viss del än idag. Men många fiskare har på senare år lagt näten på hyllan och försörjer sig i stället på den allt större skaran turister. Och till viss del består denna turistström av skandinaver, framför allt från Sverige.